Ist ein wenig von der Maschine abhängig. Allgemeingültige Antwort gibt es da keine.
Was allerdings bei jeder Maschine funktionieren müsste ist, den nicht genau definierten Teil der Departure mit dem AP im HDG Mode zu fliegen, aber bereits LNAV gearmt zu haben. Somit müsste der NAV-Mode automatisch beim auffädeln auf der gewünschten Route capturen und Du brauchst Dich um nichts mehr kümmern.
Bin flusitechnisch grade schwer im Umbau, von daher kann ich Dein Beispiel gerade nicht nachstellen, aber evtl kannst Du mir sagen um welchen Airport und welche Depature es sich genau handelt?
Bzw Charts dafür wären toll, dann kann ich Dir im Detail sagen wie mans macht.