Ich sehe bei Deinen Addons sowohl Einzelne lokale Addons, als auch Sammlungen von Airports in verschiedenen Gebieten.
Kannst Du mit 100% Sicherheit ausschließen, dass Du einige Airports dadurch doppelt hast.
Die Prioritätssteuerung in der Scenerybibliothek funktioniert auch nur unter bestimmten Bedingungen.
Evtl. mußt Du nur mal richtig Aufräumen. Für mich ist das nicht mehr überschaubar.

Dafür gibt es keine allgemeinen Regeln. Wenn Du die Dateien von beiden gleichen Airports einzeln editieren kannst, wäre ein Mix aus beiden möglich. Aber ich überschaue nicht, was Du da machst.
Ich vermeide Doppel-Installs die nur durch die Priorität steuerbar sind bei lokalen Addons. Dann lieber selber umbauen u. den Ballast entsorgen.

Um uns zu verstehen, müßten wir mal ein paar Stunden zusammen vor Deinem PC sitzen u. Du müßtest Tools zur Analyse einiger BGLs installiert haben.
Ich kann eine unkonkrete, komplexe Frage, ohne Kenntniss der vielen Randbedingungen, nur mit allgemeinen Ratschläge, aus der Kenntnis eigener Fehler oder in Foren genannter Vorkommnisse, versuchen zu beantworten. Die Trefferwahrscheinlichkeit ist daher gering. Aber die Masse der hilfsbereiten Forenteilnehmer, die hier leider fehlt, weil evtl. die Kombination Deiner Addons hier unbekannt ist, könnte die Trefferquote verbessern.